Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms