Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy4Q3TYX8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms