Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
InipQ3TXT3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms