Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms