Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms