Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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