Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem248Q3TBN1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms