Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms