Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms