Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem52bQ0VBF2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms