Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms