Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms