Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms