Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms