Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms