Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms