Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk18Q04899 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms