Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms