Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms