Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Muc1Q02496 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Muc1Q02496 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Muc1Q02496 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Muc1Q02496 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Muc1Q02496 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Muc1Q02496 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Muc1Q02496 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Muc1Q02496 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Muc1Q02496 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms