Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms