Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms