Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms