Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja5Q01231 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms