Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms