Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms