Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms