Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Bop1P97452 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms