Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx1P83917 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx1P83917 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx1P83917 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx1P83917 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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