Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms