Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprn2P80560 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms