Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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