Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms