Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.7 ms