Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms