Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrb3P63080 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms