Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab3aP63011 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab3aP63011 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3aP63011 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms