Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms