Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psme3P61290 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psme3P61290 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psme3P61290 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms