Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah1aP61092 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms