Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdhd1P59328 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdhd1P59328 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms