Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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