Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1bbP56400 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms