Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms