Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms