Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrlP54846 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrlP54846 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NrlP54846 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NrlP54846 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrlP54846 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrlP54846 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms