Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb3P54754 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms