Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms