Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacnb3P54285 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacnb3P54285 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms