Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
StomP54116 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
StomP54116 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
StomP54116 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
StomP54116 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
StomP54116 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
StomP54116 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
StomP54116 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
StomP54116 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
StomP54116 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
StomP54116 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
StomP54116 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
StomP54116 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
StomP54116 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
StomP54116 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
StomP54116 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms